Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms