Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl2Q78Y63 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms