Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Atg9aQ68FE2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Atg9aQ68FE2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms