Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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