Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SkiQ60698 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms