Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

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Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc5a6Q5U4D8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms