Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim38Q5SZ99 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms