Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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