Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms