Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3UPC7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3UPC7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms