Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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