Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms