Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms