Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms