Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hoxd1Q01822 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hoxd1Q01822 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxd1Q01822 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxd1Q01822 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxd1Q01822 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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