Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms