Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EgfrQ01279 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms