Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou1f1Q00286 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms