Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms