Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Mesp1P97309 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms