Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms