Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1bP70700 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms