Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb1P70662 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb1P70662 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb1P70662 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb1P70662 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb1P70662 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb1P70662 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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