Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms