Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CirbpP60824 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms