Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppfia3P60469 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms