Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P58686 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
P58686 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
P58686 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P58686 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P58686 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
P58686 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P58686 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
P58686 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P58686 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P58686 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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