Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcanP55066 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcanP55066 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcanP55066 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcanP55066 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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