Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnt2P50752 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms