Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FmodP50608 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FmodP50608 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FmodP50608 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms