Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnni3P48787 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms