Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt1P46096 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms