Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VhlP40338 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VhlP40338 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms