Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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