Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rfc1P35601 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc1P35601 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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