Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rab20P35295 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab20P35295 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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