Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoc1P34928 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms