Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms