Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms