Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrphP15331 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrphP15331 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrphP15331 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrphP15331 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrphP15331 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrphP15331 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrphP15331 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PrphP15331 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrphP15331 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrphP15331 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrphP15331 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms