Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01853 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01853 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01853 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01853 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01853 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01853 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01853 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01853 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01853 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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