Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms