Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1bO70237 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms