Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms