Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna5O08543 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna5O08543 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna5O08543 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms