Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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