Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm6176J3QK59 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6176J3QK59 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm6176J3QK59 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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