Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc6D3YZP9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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