Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SafbD3YXK2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms