Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem238A9JSM3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms